Muzeum bylo zřízeno za účelem získávat, shromažďovat, trvale uchovávat, evidovat, odborně zpracovávat a zpřístupňovat veřejnosti sbírky muzejní povahy, včetně doplňkových služeb odborné i široké veřejnosti.
Oddělení záchranných archeologických výzkumů řeší základní otázky archeologické památkové péče (vede Státní archeologický seznam lokalit pro západní Čechy) a provádí záchranné výzkumy na území Plzeňského kraje. Laboratorní ošetření získaných nálezů.
Oddělení záchranných archeologických výzkumů řeší základní otázky archeologické památkové péče (vede Státní archeologický seznam lokalit pro západní Čechy) a provádí záchranné výzkumy na území Plzeňského kraje. Laboratorní ošetření získaných nálezů.